El desarrollo de las tareas de apoyo para la  implementación de la Reforma Procesal Penal ha permitido determinar  que es necesario contar con mecanismos eficientes de seguimiento y monitoreo que generen información relevante, oportuna y de calidad sobre el funcionamiento del sistema, para evidenciar los resultados alcanzados, medir avances, corregir prácticas deficientes o defectuosas en la aplicación de la norma y reforzar las buenas prácticas. Dicha información  también  resulta esencial para verificar el avance de la ejecución de los resultados y el cumplimiento de los indicadores de impacto del Proyecto de Apoyo a la Reforma Procesal Penal RPP/GTZ.

En ese sentido, durante la ejecución de la 2ª fase del Proyecto, para verificar el avance y ejecución de los indicadores de impacto de RPP/GTZ, se apoyó la realización del seguimiento y monitoreo del funcionamiento del sistema procesal penal  en dos fases. En la primera fase ejecutada en la gestión 2005, el Proyecto coadyuvó en las acciones desarrolladas por el Viceministerio de Justicia (actual Ministerio de Justicia) a través de su Unidad de Política Criminal para ejecutar el Plan de Acción Estratégica aprobado en el mes de julio de 2005 por la Comisión Nacional de Implementación de la Reforma Procesal Penal, en el cual se considera el componente de seguimiento y monitoreo como una de las áreas estratégicas del proceso de implementación.

La segunda fase, fue planificada sobre la base de los resultados de la etapa previa, esencialmente respecto de tres problemas principales del funcionamiento del sistema referidos al alto índice de rechazos de denuncias, querellas y actuaciones policiales, la baja aplicación de salidas alternativas y  el índice de recursos de apelación rechazados in limine por adolecer de defectos de forma, institutos considerados en los indicadores de impacto de la 2ª fase del Proyecto RPP/GTZ.

La metodología empleada por el Proyecto RPP/GTZ con el propósito de generar información de calidad sobre el funcionamiento del sistema, permitió trabajar coordinadamente con los funcionarios de las instituciones operadoras que se encargan de procesar información estadística. Producto de esta coordinación  se identificaron los principales obstáculos existentes para establecer mecanismos permanentes de seguimiento y monitoreo, pues se registró gran parte de las limitaciones concretas de los mecanismos empleados por los operadores para generar y emplear información empírica precisa y confiable sobre el funcionamiento del sistema.

Respecto de dichas limitaciones en líneas generales se puede decir que no se aprecia una concepción integral del proceso de generación y uso de la información sobre el movimiento de causas en cada institución, lo que significa que las distintas etapas de este proceso son realizadas sin una coordinación global, lo que finalmente redunda en que el objeto final de producir información, cual es su uso para apoyar la toma de decisiones, no se realiza adecuadamente en la práctica.